Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSLP07711 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSLP07711 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSLP07711 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSLP07711 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms