Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CPA4Q9UI42 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms