Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms