Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms