Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms