Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PTPRUQ92729 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PTPRUQ92729 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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PTPRUQ92729 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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PTPRUQ92729 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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