Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HDDC3Q8N4P3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HDDC3Q8N4P3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HDDC3Q8N4P3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HDDC3Q8N4P3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HDDC3Q8N4P3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HDDC3Q8N4P3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HDDC3Q8N4P3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HDDC3Q8N4P3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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