Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms