Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTPRCAPQ14761 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRCAPQ14761 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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