Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms