Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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