Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TCIRG1Q13488 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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