Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms