Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms