Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNMTP50135 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNMTP50135 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms