Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA4P48169 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA4P48169 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA4P48169 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA4P48169 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms