Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms