Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPDP35247 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms