Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms