Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms