Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF22A3QJZ6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms