Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcd7Q9WTY1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd7Q9WTY1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdcd7Q9WTY1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd7Q9WTY1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd7Q9WTY1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcd7Q9WTY1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms