Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2bQ9DAC0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms