Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd8Q9DA37 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd8Q9DA37 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd8Q9DA37 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms