Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms