Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufs8Q8K3J1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufs8Q8K3J1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufs8Q8K3J1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms