Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD1Q6UWL2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD1Q6UWL2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms