Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga1Q3V3R4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms