Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms