Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GEN1Q17RS7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GEN1Q17RS7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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