Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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Spatc1Q148B6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Spatc1Q148B6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Spatc1Q148B6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spatc1Q148B6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Spatc1Q148B6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Spatc1Q148B6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Spatc1Q148B6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Spatc1Q148B6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Spatc1Q148B6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Spatc1Q148B6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spatc1Q148B6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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