Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 CLB2YPR119W 1476 nt5.34□□□□□ -1.55
CCE1Q03702 SUB2YDL084W 1341 nt5.34□□□□□ -1.55
CCE1Q03702 MRPL13YKR006C 795 nt5.34□□□□□ -1.55
CCE1Q03702 MSN2YMR037C 2115 nt5.34□□□□□ -1.55
CCE1Q03702 UTP18YJL069C 1785 nt5.34□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 GEP3YOR205C 1671 nt5.34□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 MRC1YCL061C 3291 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 YGR182CYGR182C 354 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 UBC4YBR082C 447 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 IES1YFL013C 2079 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 CRZ1YNL027W 2037 nt5.33□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 DUG1YFR044C 1446 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 SSK1YLR006C 2139 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 YFL064CYFL064C 525 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 SIP2YGL208W 1248 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 COS9YKL219W 1224 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 YNR048WYNR048W 1182 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 RBD2YPL246C 789 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 YPR202WYPR202W 717 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 KTR3YBR205W 1215 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 YMR155WYMR155W 1644 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 STB5YHR178W 2232 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 BAP2YBR068C 1830 nt5.32□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 KEL1YHR158C 3495 nt5.31□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 SLO1YER180C-A 258 nt5.31□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 GDB1YPR184W 4611 nt5.31□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 CLB1YGR108W 1416 nt5.31□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 DPB2YPR175W 2070 nt5.3□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 TEA1YOR337W 2280 nt5.3□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 KNH1YDL049C 807 nt5.3□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 MTQ2YDR140W 666 nt5.3□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 PRO3YER023W 861 nt5.3□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 HSP150YJL159W 1242 nt5.3□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 HAP1YLR256W 4509 nt5.3□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 RPT1YKL145W 1404 nt5.3□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.29□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 GYP1YOR070C 1914 nt5.29□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 YHR045WYHR045W 1683 nt5.29□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 YDR541CYDR541C 1035 nt5.29□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 GEX1YCL073C 1848 nt5.29□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 GEX2YKR106W 1848 nt5.29□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 MSS116YDR194C 1995 nt5.29□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 MHR1YDR296W 681 nt5.28□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 SFC1YJR095W 969 nt5.28□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 RNR3YIL066C 2610 nt5.28□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 SRP101YDR292C 1866 nt5.28□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 YJR015WYJR015W 1533 nt5.28□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 HAS1YMR290C 1518 nt5.28□□□□□ -1.56
CCE1Q03702 TAX4YJL083W 1815 nt5.27□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 ENT2YLR206W 1842 nt5.27□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 MTC5YDR128W 3447 nt5.27□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 SET5YHR207C 1581 nt5.27□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 PAP1YKR002W 1707 nt5.27□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 PSH1YOL054W 1221 nt5.27□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 TOS4YLR183C 1470 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 SCT1YBL011W 2280 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YDL023CYDL023C 321 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 RPT6YGL048C 1218 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YIL060WYIL060W 435 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YLR194CYLR194C 765 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 KEX2YNL238W 2445 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 CHL4YDR254W 1377 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 APM4YOL062C 1476 nt5.26□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 GUP2YPL189W 1830 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 FLC3YGL139W 2409 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 DED81YHR019C 1665 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YMR027WYMR027W 1413 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YHR140WYHR140W 720 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 CBF1YJR060W 1056 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 POM33YLL023C 840 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 GPM3YOL056W 912 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 DEF1YKL054C 2217 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 PHO8YDR481C 1701 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 CNM67YNL225C 1746 nt5.25□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YFL042CYFL042C 2025 nt5.24□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 COS6YGR295C 1146 nt5.24□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 VMA16YHR026W 642 nt5.24□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 HSP26YBR072W 645 nt5.24□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 HIR1YBL008W 2523 nt5.24□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 HSP104YLL026W 2727 nt5.24□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YAP1YML007W 1953 nt5.24□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 ERG7YHR072W 2196 nt5.23□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 ADE13YLR359W 1449 nt5.23□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 GET3YDL100C 1065 nt5.23□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 HEM3YDL205C 984 nt5.23□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 CBT1YKL208W 816 nt5.23□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 RHO2YNL090W 579 nt5.23□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 RDL2YOR286W 450 nt5.23□□□□□ -1.57
CCE1Q03702 YOR318CYOR318C 306 nt5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms