Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 SREBF2-207ENST00000490262 450 ntTSL 215.51■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 SREBF2-208ENST00000491541 4043 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.63e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 MTA1-209ENST00000469140 1666 ntTSL 528.58■■■□□ 2.171e-10■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.763e-6■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.63■□□□□ 0.413e-6■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.413e-6■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-6■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 CTAGE5-213ENST00000555716 558 ntTSL 48.69□□□□□ -1.023e-9■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.283e-9■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.33e-9■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.353e-9■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 46.42□□□□□ -1.383e-9■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.393e-9■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.433e-9■■■□□ 14.9
FKBP4Q02790 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.44e-6■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 216.88■□□□□ 0.294e-6■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 AXIN2-207ENST00000585045 1034 ntTSL 226.51■■□□□ 1.833e-6■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.143e-6■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 AXIN2-203ENST00000544103 621 ntTSL 320.96■□□□□ 0.953e-6■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-7■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-7■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 HS6ST1-204ENST00000494089 585 ntTSL 223.76■■□□□ 1.399e-7■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 324.15■■□□□ 1.463e-11■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.53e-11■■■□□ 14.8
FKBP4Q02790 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.226e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.076e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ARRDC1-205ENST00000466367 866 ntTSL 1 (best)28.01■■■□□ 2.076e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ARRDC1-202ENST00000419386 829 ntTSL 327.52■■■□□ 26e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ARRDC1-204ENST00000461627 882 ntTSL 227.12■■□□□ 1.936e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ARRDC1-207ENST00000471125 612 ntTSL 327.12■■□□□ 1.936e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NFKBIA-202ENST00000553342 212 ntTSL 526.22■■□□□ 1.796e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ARRDC1-211ENST00000495220 747 ntTSL 225.12■■□□□ 1.616e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.66e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NFKBIA-205ENST00000555629 599 ntTSL 224.37■■□□□ 1.496e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ARRDC1-203ENST00000431925 555 ntTSL 323.79■■□□□ 1.46e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ARRDC1-209ENST00000483563 704 ntTSL 323.61■■□□□ 1.376e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NFKBIA-207ENST00000557100 825 ntTSL 322.41■■□□□ 1.186e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 C19orf25-212ENST00000592605 357 ntTSL 322.4■■□□□ 1.186e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 C19orf25-208ENST00000589421 492 ntTSL 220.9■□□□□ 0.946e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.936e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.896e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.896e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.86e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NFKBIA-210ENST00000557459 780 ntTSL 219.99■□□□□ 0.796e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.726e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NFKBIA-203ENST00000554001 1396 ntTSL 519.43■□□□□ 0.76e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.636e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.636e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.616e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.616e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.276e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.116e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NRIP1-205ENST00000637630 573 ntTSL 315.58■□□□□ 0.086e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.076e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 B9D1-204ENST00000395616 733 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.026e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.026e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 B9D1-214ENST00000575478 553 ntTSL 214.7□□□□□ -0.066e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 414.08□□□□□ -0.166e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 LINC01004-202ENST00000450686 538 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.256e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.46e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.346e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 ASXL1-205ENST00000497249 296 ntTSL 54.42□□□□□ -1.76e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 SEPT9-245ENST00000592481 1291 ntTSL 525.35■■□□□ 1.651e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.331e-6■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 PTOV1-205ENST00000595934 1880 nt28.17■■■□□ 2.12e-7■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 PTOV1-209ENST00000597793 1716 ntTSL 1 (best)23.72■■□□□ 1.392e-7■■■□□ 14.6
FKBP4Q02790 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.571e-7■■□□□ 14.5
FKBP4Q02790 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-7■■□□□ 14.5
FKBP4Q02790 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-7■■□□□ 14.5
FKBP4Q02790 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 14.5
FKBP4Q02790 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.122e-7■■□□□ 14.5
FKBP4Q02790 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.894e-6■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 MXD4-204ENST00000513380 624 ntTSL 516.56■□□□□ 0.244e-6■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.394e-6■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ARHGAP5-208ENST00000555814 583 ntTSL 410.78□□□□□ -0.684e-6■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.284e-6■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.394e-6■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 530.26■■■□□ 2.435e-10■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)27.32■■□□□ 1.965e-10■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.95e-10■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.835e-10■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.835e-10■■□□□ 14.4
FKBP4Q02790 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 323.13■■□□□ 1.295e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-245ENST00000523137 1563 ntTSL 422.89■■□□□ 1.255e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-213ENST00000505811 1155 ntTSL 519.18■□□□□ 0.665e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-215ENST00000508103 610 ntTSL 217.62■□□□□ 0.415e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 517.27■□□□□ 0.365e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 517.26■□□□□ 0.355e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-214ENST00000506721 602 ntTSL 517.19■□□□□ 0.345e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-224ENST00000514731 1371 ntTSL 217.15■□□□□ 0.345e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-217ENST00000510431 620 ntTSL 216.97■□□□□ 0.315e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 216.44■□□□□ 0.225e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.25e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-237ENST00000520415 620 ntTSL 316.27■□□□□ 0.25e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-232ENST00000519056 530 ntTSL 416.16■□□□□ 0.185e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.15e-8■■□□□ 14.3
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 104.2 ms