Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia3P60469 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia3P60469 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms