Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt7.61□□□□□ -1.19
GEF1P37020 YIM2YMR151W 438 nt7.61□□□□□ -1.19
GEF1P37020 KSH1YNL024C-A 219 nt7.61□□□□□ -1.19
GEF1P37020 KAR5YMR065W 1515 nt7.61□□□□□ -1.19
GEF1P37020 CCT8YJL008C 1707 nt7.61□□□□□ -1.19
GEF1P37020 SHR3YDL212W 633 nt7.6□□□□□ -1.19
GEF1P37020 RPN8YOR261C 1017 nt7.6□□□□□ -1.19
GEF1P37020 IXR1YKL032C 1794 nt7.59□□□□□ -1.19
GEF1P37020 DEG1YFL001W 1329 nt7.59□□□□□ -1.19
GEF1P37020 ASN1YPR145W 1719 nt7.59□□□□□ -1.19
GEF1P37020 YGR283CYGR283C 1026 nt7.59□□□□□ -1.19
GEF1P37020 LYS1YIR034C 1122 nt7.59□□□□□ -1.19
GEF1P37020 YDR387CYDR387C 1668 nt7.59□□□□□ -1.19
GEF1P37020 RAD7YJR052W 1698 nt7.59□□□□□ -1.19
GEF1P37020 POB3YML069W 1659 nt7.59□□□□□ -1.19
GEF1P37020 CDC13YDL220C 2775 nt7.59□□□□□ -1.2
GEF1P37020 MTF2YDL044C 1323 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YBR241CYBR241C 1467 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 ENT5YDR153C 1236 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 BUD26YDR241W 288 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 TIM21YGR033C 720 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YJR146WYJR146W 354 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 OGG1YML060W 1131 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YMR295CYMR295C 594 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 AAH1YNL141W 1044 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 CTF19YPL018W 1110 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 BTS1YPL069C 1008 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YPR015CYPR015C 744 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YMR279CYMR279C 1623 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 TED1YIL039W 1422 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 MCH2YKL221W 1422 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 PRT1YOR361C 2292 nt7.58□□□□□ -1.2
GEF1P37020 MDM10YAL010C 1482 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 FAL1YDR021W 1200 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 HVG1YER039C 750 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 DSD1YGL196W 1287 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YHR112CYHR112C 1137 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 MID2YLR332W 1131 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YBL077WYBL077W 432 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 OPI11YPR044C 354 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 PRR2YDL214C 2100 nt7.57□□□□□ -1.2
GEF1P37020 snR63snR63 255 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 HYM1YKL189W 1200 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 RPL3YOR063W 1164 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 RFS1YBR052C 633 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 GAS2YLR343W 1668 nt7.56□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YPR1YDR368W 939 nt7.55□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YGR168CYGR168C 1131 nt7.55□□□□□ -1.2
GEF1P37020 GRE3YHR104W 984 nt7.55□□□□□ -1.2
GEF1P37020 MPC2YHR162W 390 nt7.55□□□□□ -1.2
GEF1P37020 HBN1YCL026C-B 582 nt7.55□□□□□ -1.2
GEF1P37020 EDE1YBL047C 4146 nt7.55□□□□□ -1.2
GEF1P37020 PTM1YKL039W 1572 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 CLN2YPL256C 1638 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 CLC1YGR167W 702 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 SEC28YIL076W 891 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 RPR2YIR015W 435 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 ELF1YKL160W 438 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 LIP2YLR239C 987 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YML018CYML018C 1182 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YPL257WYPL257W 582 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 STT3YGL022W 2157 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 RGD2YFL047W 2145 nt7.54□□□□□ -1.2
GEF1P37020 PPH22YDL188C 1134 nt7.53□□□□□ -1.2
GEF1P37020 PRM9YAR031W 897 nt7.53□□□□□ -1.2
GEF1P37020 PGA2YNL149C 390 nt7.53□□□□□ -1.2
GEF1P37020 YNL226WYNL226W 411 nt7.53□□□□□ -1.2
GEF1P37020 PTC4YBR125C 1182 nt7.53□□□□□ -1.2
GEF1P37020 RRI1YDL216C 1323 nt7.52□□□□□ -1.2
GEF1P37020 PTC3YBL056W 1407 nt7.52□□□□□ -1.2
GEF1P37020 TKL2YBR117C 2046 nt7.52□□□□□ -1.2
GEF1P37020 HIS7YBR248C 1659 nt7.52□□□□□ -1.21
GEF1P37020 CAD1YDR423C 1230 nt7.52□□□□□ -1.21
GEF1P37020 HAT2YEL056W 1206 nt7.52□□□□□ -1.21
GEF1P37020 CHO1YER026C 831 nt7.52□□□□□ -1.21
GEF1P37020 YIL089WYIL089W 618 nt7.52□□□□□ -1.21
GEF1P37020 GCN3YKR026C 918 nt7.52□□□□□ -1.21
GEF1P37020 SLM4YBR077C 489 nt7.52□□□□□ -1.21
GEF1P37020 GEX2YKR106W 1848 nt7.52□□□□□ -1.21
GEF1P37020 PRP19YLL036C 1512 nt7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms