Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM6P0DI80 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM6P0DI80 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms