Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF14O43557 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF14O43557 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF14O43557 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms