Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpna4O35343 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna4O35343 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna4O35343 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms