Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85CA6NKD9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85CA6NKD9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms