Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Itsn2Q9Z0R6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Itsn2Q9Z0R6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Itsn2Q9Z0R6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Itsn2Q9Z0R6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Itsn2Q9Z0R6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
Itsn2Q9Z0R6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Itsn2Q9Z0R6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Itsn2Q9Z0R6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Itsn2Q9Z0R6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Itsn2Q9Z0R6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Itsn2Q9Z0R6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Itsn2Q9Z0R6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Itsn2Q9Z0R6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Itsn2Q9Z0R6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Itsn2Q9Z0R6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Itsn2Q9Z0R6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Itsn2Q9Z0R6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Itsn2Q9Z0R6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Itsn2Q9Z0R6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Itsn2Q9Z0R6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Itsn2Q9Z0R6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Itsn2Q9Z0R6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Itsn2Q9Z0R6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Itsn2Q9Z0R6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Itsn2Q9Z0R6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Itsn2Q9Z0R6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Itsn2Q9Z0R6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Itsn2Q9Z0R6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Itsn2Q9Z0R6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Itsn2Q9Z0R6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Itsn2Q9Z0R6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Itsn2Q9Z0R6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Itsn2Q9Z0R6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Itsn2Q9Z0R6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Itsn2Q9Z0R6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Itsn2Q9Z0R6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Itsn2Q9Z0R6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Itsn2Q9Z0R6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Itsn2Q9Z0R6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Itsn2Q9Z0R6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Itsn2Q9Z0R6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Itsn2Q9Z0R6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Itsn2Q9Z0R6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Itsn2Q9Z0R6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Itsn2Q9Z0R6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Itsn2Q9Z0R6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Itsn2Q9Z0R6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Itsn2Q9Z0R6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Itsn2Q9Z0R6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Itsn2Q9Z0R6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Itsn2Q9Z0R6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Itsn2Q9Z0R6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Itsn2Q9Z0R6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Itsn2Q9Z0R6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Itsn2Q9Z0R6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Itsn2Q9Z0R6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Itsn2Q9Z0R6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Itsn2Q9Z0R6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Itsn2Q9Z0R6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Itsn2Q9Z0R6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Itsn2Q9Z0R6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Itsn2Q9Z0R6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Itsn2Q9Z0R6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Itsn2Q9Z0R6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Itsn2Q9Z0R6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Itsn2Q9Z0R6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Itsn2Q9Z0R6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Itsn2Q9Z0R6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Itsn2Q9Z0R6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Itsn2Q9Z0R6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Itsn2Q9Z0R6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Itsn2Q9Z0R6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Itsn2Q9Z0R6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Itsn2Q9Z0R6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Itsn2Q9Z0R6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Itsn2Q9Z0R6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Itsn2Q9Z0R6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Itsn2Q9Z0R6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Itsn2Q9Z0R6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Itsn2Q9Z0R6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Itsn2Q9Z0R6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Itsn2Q9Z0R6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Itsn2Q9Z0R6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Itsn2Q9Z0R6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Itsn2Q9Z0R6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
Itsn2Q9Z0R6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Itsn2Q9Z0R6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Itsn2Q9Z0R6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Itsn2Q9Z0R6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Itsn2Q9Z0R6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Itsn2Q9Z0R6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Itsn2Q9Z0R6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Itsn2Q9Z0R6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Itsn2Q9Z0R6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Itsn2Q9Z0R6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Itsn2Q9Z0R6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Itsn2Q9Z0R6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Itsn2Q9Z0R6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Itsn2Q9Z0R6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms