Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap4b1Q9WV76 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ap4b1Q9WV76 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap4b1Q9WV76 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap4b1Q9WV76 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap4b1Q9WV76 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ap4b1Q9WV76 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ap4b1Q9WV76 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap4b1Q9WV76 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap4b1Q9WV76 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap4b1Q9WV76 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap4b1Q9WV76 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap4b1Q9WV76 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap4b1Q9WV76 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap4b1Q9WV76 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap4b1Q9WV76 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ap4b1Q9WV76 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap4b1Q9WV76 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap4b1Q9WV76 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap4b1Q9WV76 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap4b1Q9WV76 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap4b1Q9WV76 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ap4b1Q9WV76 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap4b1Q9WV76 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap4b1Q9WV76 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap4b1Q9WV76 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap4b1Q9WV76 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap4b1Q9WV76 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap4b1Q9WV76 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap4b1Q9WV76 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap4b1Q9WV76 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap4b1Q9WV76 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap4b1Q9WV76 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap4b1Q9WV76 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap4b1Q9WV76 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap4b1Q9WV76 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ap4b1Q9WV76 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ap4b1Q9WV76 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap4b1Q9WV76 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap4b1Q9WV76 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap4b1Q9WV76 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap4b1Q9WV76 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ap4b1Q9WV76 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap4b1Q9WV76 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap4b1Q9WV76 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap4b1Q9WV76 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap4b1Q9WV76 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap4b1Q9WV76 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap4b1Q9WV76 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap4b1Q9WV76 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap4b1Q9WV76 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap4b1Q9WV76 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap4b1Q9WV76 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap4b1Q9WV76 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ap4b1Q9WV76 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ap4b1Q9WV76 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap4b1Q9WV76 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap4b1Q9WV76 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap4b1Q9WV76 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap4b1Q9WV76 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ap4b1Q9WV76 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap4b1Q9WV76 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap4b1Q9WV76 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap4b1Q9WV76 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ap4b1Q9WV76 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap4b1Q9WV76 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap4b1Q9WV76 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap4b1Q9WV76 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap4b1Q9WV76 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap4b1Q9WV76 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap4b1Q9WV76 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap4b1Q9WV76 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap4b1Q9WV76 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap4b1Q9WV76 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap4b1Q9WV76 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap4b1Q9WV76 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap4b1Q9WV76 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap4b1Q9WV76 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap4b1Q9WV76 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap4b1Q9WV76 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ap4b1Q9WV76 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap4b1Q9WV76 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ap4b1Q9WV76 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap4b1Q9WV76 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap4b1Q9WV76 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap4b1Q9WV76 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap4b1Q9WV76 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ap4b1Q9WV76 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ap4b1Q9WV76 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap4b1Q9WV76 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap4b1Q9WV76 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ap4b1Q9WV76 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap4b1Q9WV76 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ap4b1Q9WV76 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap4b1Q9WV76 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap4b1Q9WV76 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap4b1Q9WV76 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap4b1Q9WV76 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap4b1Q9WV76 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ap4b1Q9WV76 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms