Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psma1Q9R1P4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma1Q9R1P4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma1Q9R1P4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psma1Q9R1P4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma1Q9R1P4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma1Q9R1P4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma1Q9R1P4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma1Q9R1P4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma1Q9R1P4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma1Q9R1P4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psma1Q9R1P4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psma1Q9R1P4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma1Q9R1P4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma1Q9R1P4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma1Q9R1P4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma1Q9R1P4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma1Q9R1P4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psma1Q9R1P4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psma1Q9R1P4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psma1Q9R1P4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psma1Q9R1P4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psma1Q9R1P4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psma1Q9R1P4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psma1Q9R1P4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Psma1Q9R1P4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psma1Q9R1P4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psma1Q9R1P4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psma1Q9R1P4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psma1Q9R1P4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Psma1Q9R1P4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psma1Q9R1P4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psma1Q9R1P4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psma1Q9R1P4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psma1Q9R1P4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psma1Q9R1P4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma1Q9R1P4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma1Q9R1P4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma1Q9R1P4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psma1Q9R1P4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psma1Q9R1P4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma1Q9R1P4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma1Q9R1P4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma1Q9R1P4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma1Q9R1P4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma1Q9R1P4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma1Q9R1P4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma1Q9R1P4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma1Q9R1P4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psma1Q9R1P4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psma1Q9R1P4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma1Q9R1P4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma1Q9R1P4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma1Q9R1P4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma1Q9R1P4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma1Q9R1P4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma1Q9R1P4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Psma1Q9R1P4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma1Q9R1P4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psma1Q9R1P4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psma1Q9R1P4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psma1Q9R1P4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma1Q9R1P4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma1Q9R1P4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma1Q9R1P4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma1Q9R1P4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma1Q9R1P4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma1Q9R1P4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma1Q9R1P4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma1Q9R1P4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma1Q9R1P4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psma1Q9R1P4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psma1Q9R1P4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma1Q9R1P4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma1Q9R1P4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma1Q9R1P4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma1Q9R1P4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma1Q9R1P4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma1Q9R1P4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma1Q9R1P4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms