Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hacl1Q9QXE0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hacl1Q9QXE0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hacl1Q9QXE0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hacl1Q9QXE0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hacl1Q9QXE0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hacl1Q9QXE0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hacl1Q9QXE0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hacl1Q9QXE0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hacl1Q9QXE0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hacl1Q9QXE0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hacl1Q9QXE0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hacl1Q9QXE0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hacl1Q9QXE0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hacl1Q9QXE0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hacl1Q9QXE0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hacl1Q9QXE0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hacl1Q9QXE0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hacl1Q9QXE0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hacl1Q9QXE0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hacl1Q9QXE0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hacl1Q9QXE0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Hacl1Q9QXE0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hacl1Q9QXE0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hacl1Q9QXE0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hacl1Q9QXE0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hacl1Q9QXE0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hacl1Q9QXE0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hacl1Q9QXE0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hacl1Q9QXE0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hacl1Q9QXE0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Hacl1Q9QXE0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hacl1Q9QXE0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hacl1Q9QXE0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hacl1Q9QXE0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hacl1Q9QXE0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hacl1Q9QXE0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hacl1Q9QXE0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hacl1Q9QXE0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hacl1Q9QXE0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hacl1Q9QXE0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Hacl1Q9QXE0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hacl1Q9QXE0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hacl1Q9QXE0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hacl1Q9QXE0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hacl1Q9QXE0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hacl1Q9QXE0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hacl1Q9QXE0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hacl1Q9QXE0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hacl1Q9QXE0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hacl1Q9QXE0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hacl1Q9QXE0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hacl1Q9QXE0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hacl1Q9QXE0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hacl1Q9QXE0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hacl1Q9QXE0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hacl1Q9QXE0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hacl1Q9QXE0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hacl1Q9QXE0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hacl1Q9QXE0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hacl1Q9QXE0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hacl1Q9QXE0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hacl1Q9QXE0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Hacl1Q9QXE0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hacl1Q9QXE0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hacl1Q9QXE0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hacl1Q9QXE0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hacl1Q9QXE0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hacl1Q9QXE0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hacl1Q9QXE0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hacl1Q9QXE0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hacl1Q9QXE0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hacl1Q9QXE0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hacl1Q9QXE0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hacl1Q9QXE0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hacl1Q9QXE0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hacl1Q9QXE0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hacl1Q9QXE0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hacl1Q9QXE0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hacl1Q9QXE0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hacl1Q9QXE0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hacl1Q9QXE0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hacl1Q9QXE0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hacl1Q9QXE0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hacl1Q9QXE0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hacl1Q9QXE0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Hacl1Q9QXE0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hacl1Q9QXE0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hacl1Q9QXE0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hacl1Q9QXE0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hacl1Q9QXE0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hacl1Q9QXE0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms