Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Calm4Q9JM83 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Calm4Q9JM83 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Calm4Q9JM83 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Calm4Q9JM83 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Calm4Q9JM83 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Calm4Q9JM83 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Calm4Q9JM83 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Calm4Q9JM83 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Calm4Q9JM83 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Calm4Q9JM83 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Calm4Q9JM83 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Calm4Q9JM83 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Calm4Q9JM83 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Calm4Q9JM83 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Calm4Q9JM83 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Calm4Q9JM83 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Calm4Q9JM83 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Calm4Q9JM83 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Calm4Q9JM83 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Calm4Q9JM83 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Calm4Q9JM83 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Calm4Q9JM83 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Calm4Q9JM83 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Calm4Q9JM83 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Calm4Q9JM83 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Calm4Q9JM83 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Calm4Q9JM83 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Calm4Q9JM83 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Calm4Q9JM83 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Calm4Q9JM83 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Calm4Q9JM83 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Calm4Q9JM83 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Calm4Q9JM83 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
Calm4Q9JM83 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Calm4Q9JM83 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Calm4Q9JM83 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Calm4Q9JM83 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Calm4Q9JM83 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Calm4Q9JM83 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Calm4Q9JM83 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Calm4Q9JM83 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Calm4Q9JM83 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,34■■□□□ 1,17
Calm4Q9JM83 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Calm4Q9JM83 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,32■■□□□ 1,16
Calm4Q9JM83 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Calm4Q9JM83 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
Calm4Q9JM83 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Calm4Q9JM83 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Calm4Q9JM83 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Calm4Q9JM83 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Calm4Q9JM83 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Calm4Q9JM83 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Calm4Q9JM83 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Calm4Q9JM83 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Calm4Q9JM83 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Calm4Q9JM83 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Calm4Q9JM83 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Calm4Q9JM83 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Calm4Q9JM83 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Calm4Q9JM83 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Calm4Q9JM83 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Calm4Q9JM83 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Calm4Q9JM83 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,07■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,05■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Calm4Q9JM83 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms