Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,54
SacsQ9JLC8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
SacsQ9JLC8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18,38■□□□□ 0,53
SacsQ9JLC8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
SacsQ9JLC8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
SacsQ9JLC8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,34■□□□□ 0,53
SacsQ9JLC8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,34■□□□□ 0,53
SacsQ9JLC8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
SacsQ9JLC8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
SacsQ9JLC8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
SacsQ9JLC8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18,31■□□□□ 0,52
SacsQ9JLC8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18,27■□□□□ 0,52
SacsQ9JLC8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
SacsQ9JLC8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18,22■□□□□ 0,51
SacsQ9JLC8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
SacsQ9JLC8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
SacsQ9JLC8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18,16■□□□□ 0,5
SacsQ9JLC8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18,16■□□□□ 0,5
SacsQ9JLC8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18,15■□□□□ 0,5
SacsQ9JLC8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
SacsQ9JLC8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
SacsQ9JLC8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,14■□□□□ 0,49
SacsQ9JLC8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
SacsQ9JLC8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18,13■□□□□ 0,49
SacsQ9JLC8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
SacsQ9JLC8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
SacsQ9JLC8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
SacsQ9JLC8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
SacsQ9JLC8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
SacsQ9JLC8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
SacsQ9JLC8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18,02■□□□□ 0,47
SacsQ9JLC8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
SacsQ9JLC8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18,01■□□□□ 0,47
SacsQ9JLC8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
SacsQ9JLC8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
SacsQ9JLC8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17,95■□□□□ 0,46
SacsQ9JLC8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,94■□□□□ 0,46
SacsQ9JLC8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17,92■□□□□ 0,46
SacsQ9JLC8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
SacsQ9JLC8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,89■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17,89■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17,87■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17,85■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17,85■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
SacsQ9JLC8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17,83■□□□□ 0,44
SacsQ9JLC8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
SacsQ9JLC8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
SacsQ9JLC8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
SacsQ9JLC8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17,8■□□□□ 0,44
SacsQ9JLC8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17,78■□□□□ 0,44
SacsQ9JLC8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
SacsQ9JLC8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17,76■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,76■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,75■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17,74■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17,73■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17,71■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17,71■□□□□ 0,43
SacsQ9JLC8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,7■□□□□ 0,42
SacsQ9JLC8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17,7■□□□□ 0,42
SacsQ9JLC8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
SacsQ9JLC8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
SacsQ9JLC8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17,66■□□□□ 0,42
SacsQ9JLC8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
SacsQ9JLC8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
SacsQ9JLC8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17,65■□□□□ 0,42
SacsQ9JLC8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17,64■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17,59■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
SacsQ9JLC8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
SacsQ9JLC8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,57■□□□□ 0,4
SacsQ9JLC8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
SacsQ9JLC8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
SacsQ9JLC8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
SacsQ9JLC8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17,55■□□□□ 0,4
SacsQ9JLC8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17,54■□□□□ 0,4
SacsQ9JLC8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
SacsQ9JLC8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
SacsQ9JLC8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
SacsQ9JLC8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
SacsQ9JLC8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17,49■□□□□ 0,39
SacsQ9JLC8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
SacsQ9JLC8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
SacsQ9JLC8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,38
SacsQ9JLC8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
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