Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Irx5Q9JKQ4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Irx5Q9JKQ4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Irx5Q9JKQ4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Irx5Q9JKQ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Irx5Q9JKQ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Irx5Q9JKQ4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Irx5Q9JKQ4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Irx5Q9JKQ4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Irx5Q9JKQ4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Irx5Q9JKQ4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Irx5Q9JKQ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Irx5Q9JKQ4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Irx5Q9JKQ4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Irx5Q9JKQ4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Irx5Q9JKQ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Irx5Q9JKQ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Irx5Q9JKQ4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Irx5Q9JKQ4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Irx5Q9JKQ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Irx5Q9JKQ4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Irx5Q9JKQ4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Irx5Q9JKQ4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Irx5Q9JKQ4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Irx5Q9JKQ4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Irx5Q9JKQ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Irx5Q9JKQ4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Irx5Q9JKQ4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Irx5Q9JKQ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Irx5Q9JKQ4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Irx5Q9JKQ4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Irx5Q9JKQ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Irx5Q9JKQ4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Irx5Q9JKQ4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Irx5Q9JKQ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Irx5Q9JKQ4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Irx5Q9JKQ4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Irx5Q9JKQ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Irx5Q9JKQ4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Irx5Q9JKQ4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Irx5Q9JKQ4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Irx5Q9JKQ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Irx5Q9JKQ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Irx5Q9JKQ4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Irx5Q9JKQ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Irx5Q9JKQ4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Irx5Q9JKQ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Irx5Q9JKQ4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Irx5Q9JKQ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Irx5Q9JKQ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Irx5Q9JKQ4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Irx5Q9JKQ4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Irx5Q9JKQ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Irx5Q9JKQ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Irx5Q9JKQ4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Irx5Q9JKQ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Irx5Q9JKQ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Irx5Q9JKQ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Irx5Q9JKQ4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Irx5Q9JKQ4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Irx5Q9JKQ4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Irx5Q9JKQ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Irx5Q9JKQ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Irx5Q9JKQ4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Irx5Q9JKQ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Irx5Q9JKQ4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Irx5Q9JKQ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Irx5Q9JKQ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Irx5Q9JKQ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Irx5Q9JKQ4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Irx5Q9JKQ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Irx5Q9JKQ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Irx5Q9JKQ4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Irx5Q9JKQ4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Irx5Q9JKQ4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Irx5Q9JKQ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Irx5Q9JKQ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Irx5Q9JKQ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Irx5Q9JKQ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Irx5Q9JKQ4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Irx5Q9JKQ4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx5Q9JKQ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx5Q9JKQ4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Irx5Q9JKQ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Irx5Q9JKQ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Irx5Q9JKQ4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms