Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Rcan3Q9JKK0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Rcan3Q9JKK0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Rcan3Q9JKK0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,98■■■□□ 2,55
Rcan3Q9JKK0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Rcan3Q9JKK0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Rcan3Q9JKK0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Rcan3Q9JKK0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Rcan3Q9JKK0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Rcan3Q9JKK0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,76■■■□□ 2,52
Rcan3Q9JKK0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Rcan3Q9JKK0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rcan3Q9JKK0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Rcan3Q9JKK0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Rcan3Q9JKK0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rcan3Q9JKK0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Rcan3Q9JKK0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Rcan3Q9JKK0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Rcan3Q9JKK0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Rcan3Q9JKK0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Rcan3Q9JKK0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Rcan3Q9JKK0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Rcan3Q9JKK0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Rcan3Q9JKK0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Rcan3Q9JKK0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Rcan3Q9JKK0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Rcan3Q9JKK0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Rcan3Q9JKK0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Rcan3Q9JKK0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rcan3Q9JKK0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Rcan3Q9JKK0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Rcan3Q9JKK0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Rcan3Q9JKK0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Rcan3Q9JKK0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Rcan3Q9JKK0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Rcan3Q9JKK0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rcan3Q9JKK0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Rcan3Q9JKK0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Rcan3Q9JKK0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Rcan3Q9JKK0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Rcan3Q9JKK0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Rcan3Q9JKK0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Rcan3Q9JKK0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Rcan3Q9JKK0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Rcan3Q9JKK0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Rcan3Q9JKK0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Rcan3Q9JKK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Rcan3Q9JKK0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Rcan3Q9JKK0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Rcan3Q9JKK0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Rcan3Q9JKK0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Rcan3Q9JKK0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Rcan3Q9JKK0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Rcan3Q9JKK0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Rcan3Q9JKK0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Rcan3Q9JKK0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rcan3Q9JKK0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rcan3Q9JKK0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Rcan3Q9JKK0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rcan3Q9JKK0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Rcan3Q9JKK0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Rcan3Q9JKK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rcan3Q9JKK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rcan3Q9JKK0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Rcan3Q9JKK0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Rcan3Q9JKK0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rcan3Q9JKK0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rcan3Q9JKK0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Rcan3Q9JKK0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Rcan3Q9JKK0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Rcan3Q9JKK0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Rcan3Q9JKK0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Rcan3Q9JKK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Rcan3Q9JKK0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Rcan3Q9JKK0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rcan3Q9JKK0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rcan3Q9JKK0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Rcan3Q9JKK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Rcan3Q9JKK0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rcan3Q9JKK0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Rcan3Q9JKK0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Rcan3Q9JKK0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Rcan3Q9JKK0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rcan3Q9JKK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Rcan3Q9JKK0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Rcan3Q9JKK0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rcan3Q9JKK0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Rcan3Q9JKK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Rcan3Q9JKK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rcan3Q9JKK0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Rcan3Q9JKK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rcan3Q9JKK0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rcan3Q9JKK0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rcan3Q9JKK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rcan3Q9JKK0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rcan3Q9JKK0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Rcan3Q9JKK0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Rcan3Q9JKK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,2 ms