Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnbip1Q9JJN6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnbip1Q9JJN6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctnnbip1Q9JJN6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctnnbip1Q9JJN6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctnnbip1Q9JJN6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnnbip1Q9JJN6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnnbip1Q9JJN6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnbip1Q9JJN6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnbip1Q9JJN6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnbip1Q9JJN6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnbip1Q9JJN6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnbip1Q9JJN6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctnnbip1Q9JJN6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctnnbip1Q9JJN6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctnnbip1Q9JJN6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctnnbip1Q9JJN6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctnnbip1Q9JJN6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctnnbip1Q9JJN6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnbip1Q9JJN6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnbip1Q9JJN6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnbip1Q9JJN6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnbip1Q9JJN6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnbip1Q9JJN6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnbip1Q9JJN6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnnbip1Q9JJN6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnnbip1Q9JJN6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnbip1Q9JJN6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnbip1Q9JJN6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnbip1Q9JJN6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnbip1Q9JJN6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnnbip1Q9JJN6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnbip1Q9JJN6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbip1Q9JJN6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbip1Q9JJN6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnbip1Q9JJN6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnbip1Q9JJN6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbip1Q9JJN6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnbip1Q9JJN6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnbip1Q9JJN6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnbip1Q9JJN6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms