Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cacna1fQ9JIS7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cacna1fQ9JIS7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Cacna1fQ9JIS7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cacna1fQ9JIS7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cacna1fQ9JIS7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cacna1fQ9JIS7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cacna1fQ9JIS7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cacna1fQ9JIS7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cacna1fQ9JIS7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cacna1fQ9JIS7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Cacna1fQ9JIS7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cacna1fQ9JIS7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cacna1fQ9JIS7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cacna1fQ9JIS7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cacna1fQ9JIS7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cacna1fQ9JIS7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cacna1fQ9JIS7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cacna1fQ9JIS7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Cacna1fQ9JIS7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cacna1fQ9JIS7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cacna1fQ9JIS7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Cacna1fQ9JIS7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cacna1fQ9JIS7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cacna1fQ9JIS7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cacna1fQ9JIS7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cacna1fQ9JIS7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cacna1fQ9JIS7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cacna1fQ9JIS7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cacna1fQ9JIS7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cacna1fQ9JIS7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cacna1fQ9JIS7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Cacna1fQ9JIS7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Cacna1fQ9JIS7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cacna1fQ9JIS7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cacna1fQ9JIS7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cacna1fQ9JIS7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cacna1fQ9JIS7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cacna1fQ9JIS7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cacna1fQ9JIS7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cacna1fQ9JIS7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cacna1fQ9JIS7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cacna1fQ9JIS7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cacna1fQ9JIS7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cacna1fQ9JIS7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cacna1fQ9JIS7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cacna1fQ9JIS7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cacna1fQ9JIS7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Cacna1fQ9JIS7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cacna1fQ9JIS7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cacna1fQ9JIS7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Cacna1fQ9JIS7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cacna1fQ9JIS7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cacna1fQ9JIS7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cacna1fQ9JIS7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cacna1fQ9JIS7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cacna1fQ9JIS7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cacna1fQ9JIS7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cacna1fQ9JIS7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cacna1fQ9JIS7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cacna1fQ9JIS7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cacna1fQ9JIS7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cacna1fQ9JIS7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cacna1fQ9JIS7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cacna1fQ9JIS7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cacna1fQ9JIS7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cacna1fQ9JIS7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cacna1fQ9JIS7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cacna1fQ9JIS7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cacna1fQ9JIS7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cacna1fQ9JIS7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Cacna1fQ9JIS7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cacna1fQ9JIS7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cacna1fQ9JIS7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cacna1fQ9JIS7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cacna1fQ9JIS7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cacna1fQ9JIS7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Cacna1fQ9JIS7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cacna1fQ9JIS7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Cacna1fQ9JIS7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Cacna1fQ9JIS7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cacna1fQ9JIS7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cacna1fQ9JIS7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Cacna1fQ9JIS7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Cacna1fQ9JIS7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cacna1fQ9JIS7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cacna1fQ9JIS7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cacna1fQ9JIS7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cacna1fQ9JIS7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cacna1fQ9JIS7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Cacna1fQ9JIS7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cacna1fQ9JIS7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cacna1fQ9JIS7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cacna1fQ9JIS7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cacna1fQ9JIS7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms