Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Tulp4Q9JIL5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Tulp4Q9JIL5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,99■■■■□ 3,99
Tulp4Q9JIL5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,99■■■■□ 3,99
Tulp4Q9JIL5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Tulp4Q9JIL5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Tulp4Q9JIL5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,83■■■■□ 3,97
Tulp4Q9JIL5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
Tulp4Q9JIL5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Tulp4Q9JIL5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39,76■■■■□ 3,96
Tulp4Q9JIL5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Tulp4Q9JIL5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Tulp4Q9JIL5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Tulp4Q9JIL5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Tulp4Q9JIL5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
Tulp4Q9JIL5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Tulp4Q9JIL5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39,49■■■■□ 3,91
Tulp4Q9JIL5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Tulp4Q9JIL5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,45■■■■□ 3,91
Tulp4Q9JIL5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,44■■■■□ 3,9
Tulp4Q9JIL5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Tulp4Q9JIL5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39,31■■■■□ 3,88
Tulp4Q9JIL5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Tulp4Q9JIL5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Tulp4Q9JIL5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Tulp4Q9JIL5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,21■■■■□ 3,87
Tulp4Q9JIL5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Tulp4Q9JIL5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Tulp4Q9JIL5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,16■■■■□ 3,86
Tulp4Q9JIL5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Tulp4Q9JIL5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,85
Tulp4Q9JIL5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,11■■■■□ 3,85
Tulp4Q9JIL5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Tulp4Q9JIL5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Tulp4Q9JIL5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39,07■■■■□ 3,84
Tulp4Q9JIL5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Tulp4Q9JIL5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Tulp4Q9JIL5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,83
Tulp4Q9JIL5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38,99■■■■□ 3,83
Tulp4Q9JIL5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38,95■■■■□ 3,83
Tulp4Q9JIL5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Tulp4Q9JIL5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38,92■■■■□ 3,82
Tulp4Q9JIL5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Tulp4Q9JIL5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Tulp4Q9JIL5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Tulp4Q9JIL5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38,82■■■■□ 3,8
Tulp4Q9JIL5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,82■■■■□ 3,8
Tulp4Q9JIL5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Tulp4Q9JIL5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38,77■■■■□ 3,8
Tulp4Q9JIL5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38,75■■■■□ 3,79
Tulp4Q9JIL5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Tulp4Q9JIL5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,7■■■■□ 3,79
Tulp4Q9JIL5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Tulp4Q9JIL5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Tulp4Q9JIL5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Tulp4Q9JIL5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Tulp4Q9JIL5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Tulp4Q9JIL5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,74
Tulp4Q9JIL5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,74
Tulp4Q9JIL5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Tulp4Q9JIL5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Tulp4Q9JIL5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Tulp4Q9JIL5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38,38■■■■□ 3,73
Tulp4Q9JIL5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Tulp4Q9JIL5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Tulp4Q9JIL5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,3■■■■□ 3,72
Tulp4Q9JIL5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Tulp4Q9JIL5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Tulp4Q9JIL5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Tulp4Q9JIL5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Tulp4Q9JIL5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Tulp4Q9JIL5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Tulp4Q9JIL5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38,16■■■■□ 3,7
Tulp4Q9JIL5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38,16■■■■□ 3,7
Tulp4Q9JIL5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Tulp4Q9JIL5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Tulp4Q9JIL5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Tulp4Q9JIL5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Tulp4Q9JIL5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3,67
Tulp4Q9JIL5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Tulp4Q9JIL5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Tulp4Q9JIL5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37,95■■■■□ 3,67
Tulp4Q9JIL5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Tulp4Q9JIL5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Tulp4Q9JIL5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Tulp4Q9JIL5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Tulp4Q9JIL5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Tulp4Q9JIL5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37,88■■■■□ 3,66
Tulp4Q9JIL5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Tulp4Q9JIL5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Tulp4Q9JIL5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37,84■■■■□ 3,65
Tulp4Q9JIL5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Tulp4Q9JIL5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37,82■■■■□ 3,65
Tulp4Q9JIL5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Tulp4Q9JIL5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Tulp4Q9JIL5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Tulp4Q9JIL5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Tulp4Q9JIL5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Tulp4Q9JIL5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37,76■■■■□ 3,64
Tulp4Q9JIL5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms